什么是全外显子组测序?
全外显子组测序
全外显子组测序(Whole Exome Sequencing, WES)是指利用序列捕获技术一次性将人体20000多个基因的外显子区域DNA捕捉并富集后进行高通量测序的基因组分析方法。近年来,越来越多的文献表明全外显子组测序技术提高了单基因遗传病/罕见病的临床诊断率(图1)。相对于靶向基因的panel检测来说,全外显子组测序检测更全面,有利于发现更多致病性变异,诊断率更高,能大大加快精确诊断的速度,适用于各种遗传疾病。
全外显子组测序(whole exome sequencing,WES)是指利用序列捕获技术将全基因组外显子区域DNA捕捉并富集后进行高通量测序的基因组分析方法。人类基因组大约有1.8×10^5个外显子,序列总长约30Mb,占人类基因组的1%。研究表明,人类85%以上的疾病基因是由外显子上的碱基突变造成的。WES对外显子区域变异位点的检测具有很高的灵敏度和特异性,在疾病基因的识别和分子诊断中表现出极大的优越性。
技术优势及效果
全外显子组测序具有高效性和经济性。相较于核型分析、染色体微阵列分析(CMA)、CNV-seq等技术,WES的检测分辨率能够达到单个碱基变异的识别程度。因此,能够发现基因变异中的SNV(单核苷酸变异)和Indel(一个或多个碱基的插入、缺失),这也是很多遗传疾病的病因所在。大规模的研究表明,在染色体核型和染色体拷贝数分析均未见异常的胎儿中,WES技术在产前诊断中能够将超声提示结构异常胎儿的诊断率提高10%左右[1]。另一方面,相对于全基因组测序而言,全外显子组测序所需的测序深度较低,可以更快速地完成测序过程,并减少测序成本和检测周期。
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